ĐỊNH DANH ĐẾN LOÀI MỘT SỐ CHỦNG MYCOBACTERIA BẰNG PHƯƠNG PHÁP GIẢI TRÌNH TỰ GEN

http://doi.org/10.52322/jocmbmh.125.11

TÓM TẮT

Mục tiêu: Trên các chủng mycobacteria không phát hiện thấy kháng nguyên MPT64 thông qua thử nghiệm TBc ID, phân biệt phức hợp MTBC với non-tuberculous mycobacteria (NTM) và xác định tỉ lệ các loài NTM phân lập được.

Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Định danh đến loài các chủng mycobacteria bằng phương pháp phân tích trình tự các đoạn gien đích là 16S rRNA, gyrB, rpoB, hsp65 và ITS.

Kết quả: Trong số 105 chủng (100%) có TBc ID âm tính thì quan sát được 56 chủng (53,3%) là MTBC và 49 chủng (46,7%) là NTM. Trong số 56 chủng MTBC (100%), chiếm đa số là loài M. tuberculosis với 55 chủng (98,2%), 1 chủng còn lại (1,8%) thuộc về loài M. bovis. Trong số 49 chủng NTM (100%), chiếm đa số là phức hợp M. abscessus/ M. chelonae với 27 chủng (55,1%), tiếp theo là M. avium complex (MAC) với 8 chủng (16,3%) và 13 loài NTM khác với tỉ lệ nhỏ.

Kết luận: Một số chủng thuộc về MTBC không thể phát hiện được bằng thử nghiệm TBc ID thuộc về 2 loài là M. tuberculosis và M. bovis. Các loài NTM phổ biến phân lập được từ người được chẩn đoán mắc bệnh phổi do NTM bao gồm phức hợp M. abscessus/ M. chelonae và phức hợp MAC.

Từ khóa: Mycobacteria, MTBC, NTM, TBc ID, giải trình tự

 

ABSTRACT

IDENTIFICATION OF MYCOBACTERIUM SPECIES BY SEQUENCING METHODS

Objective: To discriminate and describe the prevalence between MTBC and NTM in the mycobacteria isolates at National Lung Hospital from the August of 2019 to the August of 2020, of which MPT64 cannot be detected by TBc ID.

Methods: Identification mycobacteria isolates to the species level by analysis several target genes, including 16S rRNA, gyrB, rpoB, hsp65 and ITS.

Results: Overall, there are 105 (100%) TBc ID negative strains, including 56 MTBC strains (53,3%) and 49 NTM strains (46,7%). Looking closely to species level identification, of all 56 MTBC strains, there are 55 M. tuberculosis strains (98,2%) and solely 1 M. bovis strains (1,8%). Within 49 NTM strains, the highest frequency is M. abscessus/ M. chelonae (27 strains- 55,1%), the second is MAC (8 strains- 16,3%) and other 13 NTM species take some small portions.

Conclusion: Some strains of MTBC cannot be detected by TBc ID, including M. tuberculosis and M. bovis. The predominant NTM species related to pulmonary disease in Vietnam are M. abscessus/ M. chelonae and MAC.

Keywords: Mycobacteria, MTBC, NTM, TBcID, sequencing

File toàn văn

Bài báo liên quan

• ĐẶC ĐIỂM HÌNH THÁI MI TRÊN Ở NỮ NGƯỜI VIỆT TRƯỞNG THÀNH
• ĐỊNH DANH ĐẾN LOÀI MỘT SỐ CHỦNG MYCOBACTERIA BẰNG PHƯƠNG PHÁP GIẢI TRÌNH TỰ GEN
• ĐÁNH GIÁ TÌNH TRẠNG SẢNG SAU PHẪU THUẬT TIM MỞ VỚI TUẦN HOÀN NGOÀI CƠ THỂ
• ĐÁNH GIÁ QUÁ TRÌNH CHĂM SÓC ĐIỀU DƯỠNG CHO BỆNH NHÂN SAU PHẪU THUẬT NỘI SOI CẮT TÚI MẬT
• KẾT QUẢ SỐNG THÊM KHÔNG BỆNH VÀ MỘT SỐ YẾU TỐ LIÊN QUAN TRÊN BỆNH NHÂN UNG THƯ VÚ BỘ BA ÂM TÍNH ĐƯỢC HÓA TRỊ BỔ TRỢ TRƯỚC 4AC-4T LIỀU MAU TẠI BỆNH VIỆN K
• MỨC ĐỘ LO LẮNG VỀ BẠO HÀNH TẠI NƠI LÀM VIỆC CỦA HỌC VIÊN ĐIỀU DƯỠNG TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÁI NGUYÊN VÀ MỘT SỐ YẾU TỐ LIÊN QUAN
• ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ, LÂM SÀNG, CẬN LÂM SÀNG Ở BỆNH NHÂN NHIỄM ẤU TRÙNG GIUN ĐŨA CHÓ/MÈO (TOXOCARA) TẠI TRUNG TÂM BỆNH NHIỆT ĐỚI, BỆNH VIỆN BẠCH MAI
• XÁC ĐỊNH MỨC ĐỘ NHẠY CẢM VỚI THUỐC KHÁNG NẤM CỦA CHỦNG NẤM ASPEGILLUS PHÂN LẬP ĐƯỢC Ở BỆNH NHÂN NHIỄM NẤM PHỔI XÂM LẤN TẠI BỆNH VIỆN BẠCH MAI TỪ THÁNG 7/2020-6/2021
• TÌNH TRẠNG DINH DƯỠNG VÀ CHĂM SÓC ĐIỀU DƯỠNG BỆNH NHÂN XƠ GAN VÀ CÁC YẾU TỐ LIÊN QUAN TẠI TRUNG TÂM TIÊU HÓA- GAN MẬT, BỆNH VIỆN BẠCH MAI
• ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG VÀ NHU CẦU CHĂM SÓC ĐIỀU DƯỠNG Ở NGÀY THỨ 7 CỦA NGƯỜI BỆNH CÓ HỘI CHỨNG CAI RƯỢU
• KẾT QUẢ PHẪU THUẬT NỘI SOI ĐIỀU TRỊ INSULINOMA KHÔNG SỬ DỤNG SIÊU ÂM NỘI SOI TRONG MỔ TẠI KHOA PHẪU THUẬT TIÊU HÓA GAN MẬT TỤY, BỆNH VIỆN BẠCH MAI
• TỔNG QUAN VỀ CHỈ ĐỊNH GHÉP GAN ĐIỀU TRỊ UNG THƯ BIỂU MÔ TẾ BÀO GAN