XÁC ĐỊNH CỤM LÂY TRUYỀN CÁC CHỦNG VI KHUẨN ACINETOBACTER BAUMANNII ĐA KHÁNG THUỐC TẠI KHOA HỒI SỨC TÍCH CỰC BẰNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ GEN THẾ HỆ MỚI

http://doi.org/10.52322/jocmbmh.123.13

TÓM TẮT

Mục tiêu: Xác định được các cụm lây truyền vi khuẩn A. baumannii đa kháng thuốc tại khoa HSTC là rất cần thiết để có thể can thiệp kịp thời, ngăn chặn các ổ dịch nhiễm khuẩn bệnh viện bùng phát. Mục tiêu: xác định cụm lây truyền các chủng A. baumannii đa kháng thuốc bằng kỹ thuật giải trình tự gen thế hệ mới..

Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: nghiên cứu tiến cứu, mô tả cắt ngang. Địa điểm và thời gian nghiên cứu: Khoa HSTC, bệnh viện Bệnh Nhiệt đới Trung ương; tháng 7/2017 đến tháng 1/2018. Đối tượng nghiên cứu: mẫu bệnh phẩm đờm, phân, nước tiểu và mủ vết thương (nếu có) thu thập từ BN và mẫu bệnh phẩm thu thập từ môi trường khu vực xung quanh giường bệnh.

Kết quả: từ 833 chủng A. baumannii thu thập đã xác định được 57 STs với sự nổi trội của ST2 (48%) và ST571 (24%). Các gen kháng thuốc gặp phổ biến là blaOXA (89,20%) và blaTEM (62,42%). Xác định được 39 cụm lây truyền của A. baumannii, liên quan tới từ 2 đến 22 chủng, trong đó hầu hết có liên quan đến mẫu môi trường.

Kết luận: giải trình tự gen thế hệ mới là công cụ hữu hiệu để xác định các cụm lây truyền vi khuẩn đa kháng thuốc trong bệnh viện, từ đó đề xuất các biện pháp can thiệp hiệu quả, hạn chế tối đa các ổ dịch nhiễm khuẩn bệnh viện.

Từ khóa: A. baumannii đa kháng thuốc, giải trình tự gen thế hệ mới, cụm lây truyền vi khuẩn.

 

ABSTRACT

IDENTIFICATION OF TRANSMISSION CLUSTERS OF MULTIDRUG-RESISTANT ACINETOBACTER BAUMANNII STRAINS AT INTENSIVE CARE UNIT BY NEW GENERATION GENE SEQUENCING TECHNIQUES

Introduction: Identifying the transmission clusters of multidrug-resistant A. baumannii in ICU is essential for timely intervention and control of nosocomia outbreaks.

Objectives: Identify the multidrug-resistant A. baumannii transmission clusters by Next Genome Sequencing.  

Participants and Methods: Prospective, cross-sectional study. Study location and time: ICU of National Hospital for Tropical Diseases, from 7/2017 to 1/2018. Study subjects: samples collected from patients (putum, stool, urine and wound pus (if any)) and samples collected form the environment around the hospital beds.

Results: 833 strains of A. baumannii were identified with 57 STs, of which ST2 (48%) and ST571 (24%) were predominance. The most common resistance genes were blaOXA (89.20%) and blaTEM (62.42%). 39 transmission clusters of A. baumannii were identified, involving between 2 to 22 strains, most of which were related to environmental samples.

Conclusion: Next Genome Sequencing is an effective tool to identify multidrug-resistant bacteria transmission clusters in hospitals, thereby proposing effective interventions, minimizing nosocomia outbreaks.

Keywords: multidrug resistance A. baumannii, Next Genome Sequencing, transmission cluster

File toàn văn

Bài báo liên quan

• TÌNH TRẠNG DI CĂN HẠCH CỦA UNG THƯ TUYẾN GIÁP THỂ BIỆT HÓA Ở NGƯỜI TRẺ TUỔI
• GIÁ TRỊ BẠCH CẦU ÁI TOAN TRONG ĐỢT CẤP BỆNH PHỔI TẮC NGHẼN MẠN TÍNH VÀ MỐI LIÊN QUAN ĐẾN TÁI NHẬP VIỆN
• XÁC ĐỊNH CỤM LÂY TRUYỀN CÁC CHỦNG VI KHUẨN ACINETOBACTER BAUMANNII ĐA KHÁNG THUỐC TẠI KHOA HỒI SỨC TÍCH CỰC BẰNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ GEN THẾ HỆ MỚI
• KẾT QUẢ ĐIỀU TRỊ NỘI TIẾT FULVESTRANT BƯỚC MỘT TRÊN BỆNH NHÂN UNG THƯ VÚ TÁI PHÁT DI CĂN CÓ THỤ THỂ NỘI TIẾT DƯƠNG TÍNH
• KẾT QUẢ PHẪU THUẬT UNG THƯ TUYẾN GIÁP THỂ BIỆT HÓA Ở NGƯỜI TRẺ TUỔI
• NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG, CẬN LÂM SÀNG, NGUYÊN NHÂN VÀ KẾT QUẢ ĐIỀU TRỊ HẸP ĐƯỜNG THỞ TRUNG TÂM TẠI TRUNG TÂM HÔ HẤP BỆNH VIỆN BẠCH MAI
• ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG VÀ CHI PHÍ ĐIỀU TRỊ HEN PHẾ QUẢN TẠI ĐƠN VỊ QUẢN LÝ NGOẠI TRÚ BỆNH PHỔI MẠN TÍNH BỆNH VIỆN ĐA KHOA ĐỐNG ĐA NĂM 2020
• TỶ LỆ NHẬP VIỆN VÀ YẾU TỐ LIÊN QUAN ĐẾN THỜI GIAN NẰM VIỆN CỦA NHỮNG BỆNH NHÂN HÔ HẤP VÀ TIM MẠCH TẠI BỆNH VIỆN BẠCH MAI GIAI ĐOẠN 2018 - 2019
• MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM RỐI LOẠN TÂM THẦN LIÊN QUAN SỬ DỤNG CHẤT TÁC ĐỘNG TÂM THẦN Ở BỆNH NHÂN NỘI TRÚ ĐIỀU TRỊ TẠI BỆNH VIỆN BẠCH MAI
• HIỆU QUẢ CAI THUỐC LÁ CỦA PHƯƠNG PHÁP TƯ VẤN TRỰC TIẾP TRÊN NHÓM BỆNH NHÂN HÔ HẤP NHẬP VIỆN TẠI BỆNH VIỆN BẠCH MAI
• KHẢ NĂNG GIAO TIẾP VỚI ĐỒNG NGHIỆP VÀ NGƯỜI BỆNH CỦA ĐIỀU DƯỠNG VIÊN TẠI MỘT SỐ BỆNH VIỆN KHU VỰC MIỀN NÚI PHÍA BẮC
• PHÙ NỀ PHẦN MỀM DƯỚI DA GÂY BIẾN DẠNG MẶT Ở MỘT TRẺ BỊ BAN XUẤT HUYẾT HENOCH-SCHÖNLEIN
• NGHIÊN CỨU TỔNG QUAN TUÂN THỦ ĐIỀU TRỊ DỰ PHÒNG TRƯỚC PHƠI NHIỄM HIV (PrEP) Ở NHÓM NAM QUAN HỆ TÌNH DỤC ĐỒNG GIỚI (MSM)
• CẮT KHỐI TÁ TRÀNG TOÀN BỘ TỤY Ở BỆNH NHÂN UNG THƯ: BÁO CÁO CA LÂM SÀNG VÀ TỔNG QUAN CHỈ ĐỊNH, THEO DÕI VÀ ĐIỀU TRỊ BỆNH NHÂN SAU MỔ
• CHÈN ÉP TỦY NGỰC DO U TẠO MÁU NGOÀI TỦY XƯƠNG Ở NGƯỜI BỆNH THALASSEMIA: BÁO CÁO 2 CA LÂM SÀNG VÀ NHÌN LẠI Y VĂN